Vụ án đầu tiên mang tên “Điệp vụ tìm đối đầu” do Khả Như dàn dựng và có sự tham gia diễn xuất của diễn viên hài Quang Trung cùng các thành viên trong nhóm Buffalo như: Hoàng Khôi, Lê Nghĩa, Lương Thăng.
Vụ án thứ 2 mang tên “Điệp vụ đối đầu” do Nam Thư dàn dựng, với sự tham gia diễn xuất của Quán quân Cười Xuyên Việt 2016 Anh Tú, diễn viên Quốc Khánh, Hồng Thanh, Minh Dự, Thanh Trực, Mai Tài Phến.
Ngoài 2 vụ án trên, tập cuối của "Điệp vụ đối đầu" còn tiết lộ những thông tin thú vị trong quá trình thực hiện chương trình, thông qua phần talk đầy hấp dẫn giữa MC Liêu Hà Trinh và đạo diễn Diệp Tiên – người dàn dựng và đứng đàng sau các mật vụ gay cấn của chương trình, quân sư Huỳnh Lập, thủ lĩnh Nam Thư và thủ lĩnh Khả Như. Đạo diễn Diệp Tiên chia sẻ: “Trong suốt quá trình thực hiện chương trình, tôi đã mất ngủ rất nhiều để suy nghĩ ý tưởng cho các mật vụ. Để thực hiện các mật vụ với các tình tiết trinh thám hình sự, phá án trên sân khấu với nhiều người có động cơ gây án cũng khá “nát óc” cho nên khi dàn dựng xong thì cảm thấy khá thoải mái”. Là bình luận viên xuyên suốt chương trình đưa ra những tư vấn cho các đội phá án, diễn viên Huỳnh Lập dí dỏm: “Ban đầu Huỳnh Lập thấy đạo diễn Diệp Tiên rất dễ thương nhưng sau khi thấy anh dàn dựng các mật vụ thì cảm thấy anh rất mưu mô, xảo trá”. Đồng tình với Huỳnh Lập, Nam Thư gợi ý Điệp vụ đối đầu nên có thêm tập giết “trùm cuối” Diệp Tiên vì anh là người đưa ra các vụ án quá…ác!!!. Khi được MC Liêu Hà Trinh hỏi về việc một vài khán giả nói rằng trong chương trình Nam Thư nhìn có vẻ chảnh, dữ, lất át sân chơi, Nam Thư đã giải thích: “Cuộc đời Nam Thư sinh ra để đóng vai ác, đóng mẹ Cám, vai Cám chứ không bao giờ được đóng vai Tấm. Vấn đề đầu tiên thuộc về cơ mặt của Nam Thư, vấn đề tiếp theo như đạo diễn Diệp Tiên cho biết không được bỏ qua bất kỳ chi tiết nào nên Nam Thư rất tập trung để tìm ra các chi tiết phá án và để chương trình hấp dẫn hơn, cần phải có 1 người đóng vai ác và người đó là Thư”. Trái với vẻ căng thẳng, mạnh mẽ của Nam Thư, trong suốt 13 tập của chương trình, thủ lĩnh Khả Như gắn liền với hình ảnh thân thiện, vui vẻ và các điệp viên của cô như cô nói lúc nào cũng “sụi-bại-đụi” vì thua liên tục. Đến tận điệp vụ cuối cùng, Khả Như mới lần đầu tiên chiến thắng thuyết phục trước thủ lĩnh Nam Thư. Thủ lĩnh Khả Như thừa nhận: “Khả Như là người nhát, thiếu quyết đoán dù đoán đúng nhưng không dám ra hiệu lệnh. Chương trình Điệp vụ đối đầu là nơi bộc lộ rõ ràng tính cách của mỗi người nhất”. Ngoài đạo diễn và các diễn viên tham gia chương trình, MC Liêu Hà Trinh là nhân vật được nhiều khán giả yêu thích trong chương trình với phong cách dẫn cá tính, năng động, thông minh và những pha hóa thân vào các nhân vật trong vụ án để giới thiệu từng mật vụ.
Chương trình "Điệp vụ đối đầu" có 13 tập, 12 mật vụ và có sự tham gia của gần 100 nghệ sĩ. Trong 12 mật vụ, có 10 mật vụ được 2 thủ lĩnh phá án thành công, 2 mật vụ không phá được. Trong đó, mỗi nữ thủ lĩnh chiến thắng được 5 mật vụ.