Tối 21.5, TS-BS Nguyễn Văn Vĩnh Châu, Giám đốc Bệnh viện Bệnh nhiệt đới TP.HCM, cho biết đã có báo cáo nhanh Cục Y tế dự phòng (Bộ Y tế) và Sở Y tế TP.HCM kết quả giải mã bộ gen SARS-CoV-2 từ bệnh nhân Covid-19 4583 (từ Hải Phòng về ngụ Q.7) và BN 4780 (ngụ hẻm 287 Nguyễn Đình Chiểu, P.5, Q.3).
Theo đó, nhóm nghiên cứu Covid-19 của Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới và Đơn vị nghiên cứu lâm sàng Đại học Oxford đã tiến hành giải mã nhanh bộ gen của SARS-CoV-2 từ bệnh nhân (BN) 4583 (ngụ Q.7, qua điều tra dịch tễ học được cho là có liên quan đến BN 4514 tại TP.Thủ Đức và BN 4780 trong chùm ca bệnh ở hẻm 287 Nguyễn Đình Chiểu, P.5, Q.3).
Phương pháp sử dụng: Giải mã gen bằng kỹ thuật Illumina MiSeq và MinION. Phần mềm lắp ghép bộ gene Genious. Định danh biến chủng bằng phần mềm Pangolin và tìm đột biến bằng phần mềm COV-GLUE.
Kết quả thu nhận được hai bộ gen SARS-CoV-2 từ 2 mẫu RNA đưa vào phân tích. Kết quả định danh bằng phần mềm Pangolin cho thấy:
Mẫu từ BN 4583: biến chủng B.1.617.2. Mẫu từ BN 4780: biến chủng B.1.1.7
Kết quả xác định đột biến bằng COV-GLUE cho thấy các bộ gen thu nhận chứa các đột biến tiêu biểu của biến chủng B.1.1.7 và biến chủng B.1.617.2 tương ứng.
Nhóm nghiên cứu kết luận: Kết hợp kết quả giải mã gen với thông tin dịch tễ có thể khẳng định BN 4583 (Q.7) và BN 4514 (Thành phố Thủ Đức) có cùng một nguồn lây do biến chủng B.1.617.2 (biến chủng Ấn Độ) đang gây dịch ở phía bắc.
BN 4780 (hẻm 287 Nguyễn Đình Chiểu, P.5, Q.3) nhiễm biến chủng B.1.1.7. Đây là biến chủng Anh đang lưu hành tại Đà Nẵng và Hà Nam, hiện nay đã lây lan ra các tỉnh khu vực miền Trung; cũng đã phát hiện được trên BN 1660 (từ Hải Dương ngày 29.1) và BN 2910 (từ Hà Nam ngày 29.4) được cách ly điều trị tại Bệnh viện dã chiến Củ Chi trước đây.
Như vậy, đây là lần đầu tiên TPHCM ghi nhận sự lưu hành đồng thời của cả hai biến chủng được cho là có khả năng lây lan nhanh (biến chủng Ấn Độ và biến chủng Anh) ở các ca bệnh trong cộng đồng, trong đó có ca bệnh ở hẻm 287 Nguyễn Đình chiểu, P.5, Q.3.
Bình luận (0)